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Consanguineità

Il monitoraggio della consanguineità è essenziale per mantenere la diversità genetica e la vitalità delle vostre colonie. BeePass calcola il coefficiente di consanguineità a partire dal pedigree e vi aiuta a prendere decisioni di accoppiamento consapevoli.

Coefficiente di consanguineità​

Il coefficiente di consanguineità (F) misura la probabilità che i due alleli di un gene in un individuo siano identici per discendenza (provengano dallo stesso antenato). Viene calcolato a partire dalla matrice A⁻¹ (matrice inversa delle relazioni genetiche additive).

BeePass utilizza il pacchetto AINV-honeybees v20, che implementa l'algoritmo di Brascamp & Bijma (2014) specificamente progettato per le api.

Specificità delle api​

Il calcolo della consanguineità nell'ape è fondamentalmente diverso da quello dei mammiferi:

  • Aplo-diploidia — I fuchi (maschi) sono aploidi: possiedono un solo set di cromosomi, ereditato integralmente dalla madre. Le formule classiche di consanguineità (Wright, 1922) non si applicano direttamente.
  • Poliandria — La regina si accoppia con 10-20 fuchi. Le operaie di una stessa colonia sono un mix di sorellastre e super-sorelle (stesso padre fuco).
  • Alleli sessuali (CSD) — Nell'ape, il sesso è determinato dal locus CSD. Se i due alleli sono identici (omozigosi), la larva è un maschio diploide, eliminato dalle operaie. Una consanguineità elevata aumenta la proporzione di questi maschi diploidi sterili.
AINV-honeybees v20

BeePass utilizza AINV-honeybees v20 (Brascamp & Bijma, 2014), un modulo dedicato al calcolo della matrice di parentela inversa per le api. Questo modulo tiene conto dell'aplo-diploidia e della poliandria nel calcolo dei coefficienti.

Interpretazione​

Coefficiente FSignificatoRelazione tipica
0%Nessun antenato comune conosciutoLinee non imparentate
6,25%Antenati comuni lontaniFratellastri/sorellastre
12,5%Antenati comuni viciniCugini primi
25%Parentela forteGenitore-discendente

Obiettivo: mantenere il coefficiente di consanguineità al di sotto del 10% nel vostro programma di selezione.

Evitare la consanguineità​

Diverse strategie permettono di limitare la consanguineità:

  1. Diversificare i gruppi di maschi — Utilizzate fuchi provenienti da linee non imparentate con le vostre regine.
  2. Variare le fonti di fuchi — Scambiate regine madri di maschi con altri allevatori.
  3. Consultare il pedigree — Prima di ogni decisione di accoppiamento, verificate l'albero genealogico su 5-7 generazioni per individuare antenati comuni.
  4. Utilizzare l'Index BeePass — Confrontate i pedigree delle regine di riferimento per identificare linee complementari.
Consanguineità elevata

Una consanguineità superiore al 12,5% comporta una depressione da consanguineità: calo della vitalità delle colonie, riduzione della resistenza alle malattie, aumento dei maschi diploidi (non vitali) e diminuzione del successo riproduttivo.

Come BeePass calcola la consanguineità​

BeePass utilizza il pacchetto AINV-honeybees v20, che implementa l'algoritmo di Brascamp & Bijma (2014) specificamente progettato per l'aplo-diploidia delle api.

Il calcolo avviene automaticamente in diverse fasi:

  1. Costruzione del pedigree -- BeePass legge l'albero genealogico di ogni regina (madre, gruppo di maschi, nonni) a partire dai dati registrati.
  2. Calcolo della matrice A-1 -- La matrice inversa delle relazioni genetiche additive viene costruita. Codifica i legami di parentela tra tutte le regine del vostro allevamento.
  3. Gestione SDI e MDI -- L'algoritmo distingue le inseminazioni con un singolo maschio (SDI, sdi_code = 1) e con più maschi (MDI, sdi_code = 2). I coefficienti di parentela vengono adeguati di conseguenza.
  4. Fondatrici -- Le regine senza genitori conosciuti (fondatrici) vengono trattate come non imparentate tra loro. Ciò evita di sovrastimare la consanguineità quando il pedigree è incompleto.
  5. Aggiustamento degli EBV -- I valori genetici stimati vengono automaticamente corretti per tener conto del livello di consanguineità di ogni individuo.
suggerimento

Non dovete calcolare nulla -- BeePass lo fa automaticamente a partire dal vostro pedigree. Assicuratevi semplicemente che le informazioni di filiazione (madre, gruppo di maschi) siano correttamente inserite per ogni regina.

Vedi anche: