Перейти к основному содержимому

Инбридинг

Отслеживание инбридинга необходимо для поддержания генетического разнообразия и жизнеспособности семей. BeePass вычисляет коэффициент инбридинга на основе родословной и помогает вам принимать обоснованные решения о спаривании.

Коэффициент инбридинга​

Коэффициент инбридинга (F) измеряет вероятность того, что оба аллеля в генном локусе у особи идентичны по происхождению (унаследованы от одного и того же предка). Он рассчитывается на основе матрицы A^(-1) (обратной матрицы аддитивного генетического родства).

BeePass использует пакет AINV-honeybees v20, который реализует алгоритм Brascamp & Bijma (2014), специально разработанный для медоносных пчёл.

Особенности медоносных пчёл​

Расчёт инбридинга у медоносных пчёл принципиально отличается от млекопитающих:

  • Гапло-диплоидия -- Трутни (самцы) гаплоидны: они несут только один набор хромосом, полностью унаследованный от матери. Классические формулы инбридинга (Wright, 1922) не применяются напрямую.
  • Полиандрия -- Матка спаривается с 10-20 трутнями. Рабочие пчёлы одной семьи представляют собой смесь полусестёр и суперсестёр (от одного и того же отца-трутня).
  • Половые аллели (CSD) -- У медоносных пчёл пол определяется локусом CSD. Если оба аллеля идентичны (гомозиготность), личинка развивается в диплоидного самца, который уничтожается рабочими пчёлами. Высокий инбридинг увеличивает долю таких стерильных диплоидных самцов.
AINV-honeybees v20

BeePass использует AINV-honeybees v20 (Brascamp & Bijma, 2014), специализированный модуль для вычисления обратной матрицы родства у медоносных пчёл. Этот модуль учитывает гапло-диплоидию и полиандрию при расчёте коэффициентов.

Интерпретация​

Коэффициент FЗначениеТипичное родство
0%Нет известных общих предковНеродственные линии
6,25%Отдалённые общие предкиПолусибсы
12,5%Близкие общие предкиДвоюродные
25%Сильное родствоРодитель-потомок

Цель: поддерживать коэффициент инбридинга ниже 10% в вашей селекционной программе.

Избежание инбридинга​

Несколько стратегий помогают ограничить инбридинг:

  1. Разнообразить группы отцов -- Используйте трутней из линий, неродственных вашим маткам.
  2. Варьировать источники трутней -- Обменивайтесь трутнёвыми матками с другими заводчиками.
  3. Проверять родословную -- Перед каждым решением о спаривании просматривайте родословное дерево на 5-7 поколений для выявления общих предков.
  4. Использовать Индекс BeePass -- Сравнивайте родословные референсных маток для определения комплементарных линий.
Высокий инбридинг

Инбридинг выше 12,5% приводит к инбредной депрессии: снижение жизнеспособности семьи, ослабление устойчивости к болезням, увеличение числа диплоидных самцов (нежизнеспособных) и снижение репродуктивного успеха.

Смотрите также: